[1]
|
NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA].
STRAIN=cv. Nipponbare;
Tahir M.,
Kanegae H.,
Takano M.;
"Phytochrome C (PHYC) gene in rice: isolation and characterization of a complete coding sequence.";
(er) Plant Gene Register PGR98-210.
|
[2]
|
NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
STRAIN=cv. Nipponbare;
DOI=10.1101/gr.3869505; PubMed=16109971 [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan] The rice chromosome 3 sequencing consortium;
Buell C.R.,
Yuan Q.,
Ouyang S.,
Liu J.,
Zhu W.,
Wang A.,
Maiti R.,
Haas B.,
Wortman J.,
Pertea M.,
Jones K.M.,
Kim M.,
Overton L.,
Tsitrin T.,
Fadrosh D.,
Bera J.,
Weaver B.,
Jin S.,
Johri S.,
Reardon M.,
Webb K.,
Hill J.,
Moffat K.,
Tallon L.,
Van Aken S.,
Lewis M.,
Utterback T.,
Feldblyum T.,
Zismann V.,
Iobst S.,
Hsiao J.,
de Vazeille A.R.,
Salzberg S.L.,
White O.,
Fraser C.M.,
Yu Y.,
Kim H.-I.,
Rambo T.,
Currie J.,
Collura K.,
Kernodle-Thompson S.,
Wei F.,
Kudrna K.,
Ammiraju J.S.S.,
Luo M.,
Goicoechea J.L.,
Wing R.A.,
Henry D.,
Oates R.,
Palmer M.,
Pries G.,
Saski C.,
Simmons J.,
Soderlund C.,
Nelson W.,
de la Bastide M.,
Spiegel L.,
Nascimento L.,
Huang E.,
Preston R.,
Zutavern T.,
Palmer L.,
O'Shaughnessy A.,
Dike S.,
McCombie W.R.,
Minx P.,
Cordum H.,
Wilson R.,
Jin W.,
Lee H.R.,
Jiang J.,
Jackson S.;
"Sequence, annotation, and analysis of synteny between rice chromosome 3 and diverged grass species.";
Genome Res. 15:1284-1291(2005).
|
[3]
|
NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
STRAIN=cv. Nipponbare;
DOI=10.1038/nature03895; PubMed=16100779 [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan] International rice genome sequencing project (IRGSP);
"The map-based sequence of the rice genome.";
Nature 436:793-800(2005).
|
[4]
|
GENOME REANNOTATION.
STRAIN=cv. Nipponbare;
DOI=10.1101/gr.5509507; PubMed=17210932 [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan] The rice annotation project (RAP);
"Curated genome annotation of Oryza sativa ssp. japonica and comparative genome analysis with Arabidopsis thaliana.";
Genome Res. 17:175-183(2007).
|
[5]
|
NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
STRAIN=cv. Nipponbare;
DOI=10.1371/journal.pbio.0030038; PubMed=15685292 [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan]
Yu J.,
Wang J.,
Lin W.,
Li S.,
Li H.,
Zhou J.,
Ni P.,
Dong W.,
Hu S.,
Zeng C.,
Zhang J.,
Zhang Y.,
Li R.,
Xu Z.,
Li S.,
Li X.,
Zheng H.,
Cong L.,
Lin L.,
Yin J.,
Geng J.,
Li G.,
Shi J.,
Liu J.,
Lv H.,
Li J.,
Wang J.,
Deng Y.,
Ran L.,
Shi X.,
Wang X.,
Wu Q.,
Li C.,
Ren X.,
Wang J.,
Wang X.,
Li D.,
Liu D.,
Zhang X.,
Ji Z.,
Zhao W.,
Sun Y.,
Zhang Z.,
Bao J.,
Han Y.,
Dong L.,
Ji J.,
Chen P.,
Wu S.,
Liu J.,
Xiao Y.,
Bu D.,
Tan J.,
Yang L.,
Ye C.,
Zhang J.,
Xu J.,
Zhou Y.,
Yu Y.,
Zhang B.,
Zhuang S.,
Wei H.,
Liu B.,
Lei M.,
Yu H.,
Li Y.,
Xu H.,
Wei S.,
He X.,
Fang L.,
Zhang Z.,
Zhang Y.,
Huang X.,
Su Z.,
Tong W.,
Li J.,
Tong Z.,
Li S.,
Ye J.,
Wang L.,
Fang L.,
Lei T.,
Chen C.-S.,
Chen H.-C.,
Xu Z.,
Li H.,
Huang H.,
Zhang F.,
Xu H.,
Li N.,
Zhao C.,
Li S.,
Dong L.,
Huang Y.,
Li L.,
Xi Y.,
Qi Q.,
Li W.,
Zhang B.,
Hu W.,
Zhang Y.,
Tian X.,
Jiao Y.,
Liang X.,
Jin J.,
Gao L.,
Zheng W.,
Hao B.,
Liu S.-M.,
Wang W.,
Yuan L.,
Cao M.,
McDermott J.,
Samudrala R.,
Wang J.,
Wong G.K.-S.,
Yang H.;
"The genomes of Oryza sativa: a history of duplications.";
PLoS Biol. 3:266-281(2005).
|
[6]
|
NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] OF 275-378.
PubMed=8865668 [NCBI, ExPASy, EBI, Israel, Japan]
Mathews S.,
Sharrock R.A.;
"The phytochrome gene family in grasses (Poaceae): a phylogeny and evidence that grasses have a subset of the loci found in dicot angiosperms.";
Mol. Biol. Evol. 13:1141-1150(1996).
|
|