PROSITE - Entry: PS51278

ExPASy Home page

Site Map

Search ExPASy

Contact us

PROSITE

Hosted by

Mirror sites:

The ExPASy Server requires Javascript to be fully functional. You may not see all the information available for this page (More information).

Entry: PS51278

General information about the entry
Entry name	GATASE_TYPE_2
Accession number	PS51278
Entry type	MATRIX
Date	NOV-2006 (CREATED); NOV-2006 (DATA UPDATE); OCT-2008 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation	PDOC00406
Associated ProRule	PRU00609
Name and characterization of the entry
Description	Glutamine amidotransferase type 2 domain profile.
Matrix / Profile	/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=224; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=219; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2477429; R2=0.0193796; TEXT='-LogE'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=375; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=272; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -3, -9,-29, -9,-12,-27, 43,-14,-35, -9,-27,-17, 0,-19,-11, -2, 0,-16,-26,-21,-25,-12; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-36,-27, 6,-35,-27, 34,-27, 20, 15,-24,-24,-22,-25,-21, -9, 24,-11, 1,-27; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='F'; M= -1,-22,-13,-27,-21, 14,-21,-18, 8,-21, 10, 5,-18,-23,-21,-18,-11, -4, 11,-13, 2,-20; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= 8,-12,-22,-14,-19,-24, 46,-20,-29,-19,-22,-16, -4,-19,-18,-20, 0,-15,-20,-20,-25,-19; /M: SY='Y'; M= -8,-24,-20,-29,-23, 15,-27,-13, 14,-20, 9, 8,-21,-26,-19,-19,-16, -8, 11, -4, 18,-23; /M: SY='V'; M= -5,-20,-19,-24,-18, 2,-24,-14, 8,-15, 3, 4,-16,-22,-14,-12, -9, -4, 9,-14, 1,-17; /M: SY='G'; M= 4, -3,-18, -6, -9,-20, 16,-12,-23,-11,-20,-14, 3,-17,-10,-12, 6, -4,-16,-25,-19,-10; /I: I=-4; MD=-21; /M: M= -3, -4,-17, -6, -3,-10,-12, -3,-12, -2,-10, -7, -1,-11, -3, 0, -2, -1,-10,-18, -6, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='P'; M= -5, -3,-17, -2, -1,-14, -8, -6,-11, -2,-11, -7, -1, 2, -2, -2, -2, -2,-10,-19,-11, -3; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='P'; M= -2, -3,-17, -3, -1,-15, -6, -8,-12, -3,-12, -9, -2, 3, -3, -5, 0, -2,-11,-19,-12, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='N'; M= -4, 1,-18, 0, 2,-16,-10, -3,-15, 0,-15,-10, 3, -7, 1, 0, 3, 0,-13,-21, -9, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='E'; M= -7, 1,-24, 3, 6,-20,-13, 5,-20, 4,-17,-10, 2, -8, 3, 6, -2, -6,-17,-24, -9, 3; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='E'; M= -6, 0,-23, 2, 3,-16,-14, -7,-15, -3,-15,-11, -1, -3, -2, -6, -2, -5,-14,-25,-11, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='V'; M= 4,-12,-15,-15,-11,-10,-17,-17, 1,-13, 0, -2,-11,-18,-12,-15, -4, -1, 5,-24,-10,-12; /M: M= -1,-11,-21,-13, -7,-13,-13,-11, -6, -8, -7, -4, -8,-11, -8, -8, -4, -5, -4,-25,-11, -9; /M: SY='E'; M= -4, 3,-24, 5, 9,-23,-13, -7,-20, 1,-20,-13, 2, -4, 5, 0, 4, -1,-17,-28,-16, 6; /I: I=-5; MD=-25; /M: M= -7, -8,-22, -9, -5,-11,-21,-10, -2, -7, 0, 0, -8,-15, -4, -7, -7, -4, -2,-22, -6, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='L'; M= 1,-20,-15,-23,-17, -1,-20,-19, 11,-20, 14, 6,-17,-21,-16,-18,-10, -3, 9,-21, -6,-17; D=-5; /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='L'; M= -4,-15,-17,-17,-11, -3,-21,-10, 2,-12, 4, 2,-12,-18, -9,-11, -9, -5, 1,-18, 1,-11; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='E'; M= -8, 3,-23, 4, 7,-16,-15, -1,-19, 1,-14,-10, 3,-13, 3, 0, -2, -5,-17,-24, -8, 4; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='A'; M= 5,-11,-15,-16,-13,-14, 4,-13, -9,-14, -6, 2, -7,-17,-10,-14, 2, -4, -5,-25,-15,-12; /M: SY='L'; M= -6,-21,-19,-24,-16, 4,-24,-15, 8,-21, 22, 9,-19,-22,-15,-14,-16, -6, 3,-19, -2,-16; /M: SY='E'; M= -8, -1,-22, -1, 3,-18,-17, -2,-15, 1,-12, -6, -2,-15, 3, 2, -4, -6,-13,-24, -7, 2; /M: SY='R'; M= 3, -6,-20, -9, -4,-18,-10, -9,-16, 2,-13, -8, -2,-14, -2, 5, 0, -3,-11,-24,-13, -4; /M: SY='L'; M= -9,-22,-22,-24,-16, 1,-27,-13, 15,-20, 26, 18,-21,-24,-10,-15,-20, -9, 8,-21, -1,-14; /M: SY='E'; M= -5, 1,-23, 1, 15,-24,-15, 0,-20, 4,-17, -9, 0,-10, 14, 3, 1, -3,-19,-25,-12, 14; /M: SY='H'; M=-14, -3,-25, -4, -3,-11,-19, 46,-20, -6,-15, -2, 3,-19, 3, -1, -8,-12,-20,-20, 16, -3; /M: SY='R'; M=-18, -9,-28,-10, -1,-20,-20, -2,-27, 26,-19, -9, -1,-19, 8, 60, -9, -7,-18,-21,-10, -1; /M: SY='G'; M= 0, -6,-28, -7,-15,-28, 53,-14,-36,-16,-28,-19, 3,-19,-16,-16, 2,-15,-28,-22,-26,-15; /M: SY='P'; M= -7,-11,-31, -9, -3,-19,-10, -4,-18, -5,-20,-11, -9, 20, 1, -8, -6, -8,-22,-18, -6, -4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='D'; M=-17, 39,-28, 55, 22,-35,-12, 3,-36, 0,-27,-26, 16,-10, 2, -8, 0,-10,-28,-37,-18, 12; /M: SY='G'; M= 7, -4,-22, -5, -9,-24, 29,-14,-29,-13,-26,-18, 2,-15,-10,-15, 12, -5,-20,-24,-22, -9; /M: SY='A'; M= 9,-14,-11,-19,-12, -2,-12,-17,-13,-13,-11,-10,-11,-18,-13,-14, 0, -2, -7, -6, -6,-11; /M: SY='G'; M= 0, -9,-29, -9,-18,-29, 63,-18,-38,-18,-29,-19, 1,-20,-18,-18, 0,-19,-29,-21,-29,-18; /M: SY='I'; M= -9,-26,-21,-31,-24, 6,-32,-21, 27,-23, 17, 14,-21,-24,-19,-20,-17, -6, 20,-18, 3,-23; /M: SY='A'; M= 13,-16,-16,-20,-15, -8, -4,-14, -9,-15, -7, -6,-13,-19,-13,-17, -4, -6, -4, -7, -6,-14; /M: SY='V'; M= -4,-19,-18,-24,-18, 2,-22,-18, 4,-16, 1, 0,-17,-22,-16,-15, -9, -1, 6, -4, 1,-17; /I: I=0; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2; /M: M= -2, -4,-14, -4, -3, -8, -8, -7, -6, -6, -4, -4, -4,-10, -5, -7, -1, -1, -4,-16, -7, -4; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='D'; M= -7, 3,-18, 4, 2,-14, -7, -2,-15, 3,-13, -9, 3, -8, 0, 3, 0, -3,-12,-18, -7, 0; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='G'; M= -3, 1,-18, 1, 0,-17, 4, -5,-18, -2,-16,-11, 3, -5, -2, -3, 1, -4,-14,-19,-12, -2; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -4, 0,-17, 0, 1,-15, -3, -5,-14, -1,-12, -8, 1, -9, -1, -1, 1, -2,-10,-19,-10, -1; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='P'; M= -5, -4,-18, -4, 0,-16, -8, -5,-13, 1,-14, -8, -2, 5, 0, 1, -2, -4,-13,-18,-11, -2; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='I'; M= -6,-15,-12,-17,-13, 4,-15,-10, 6,-14, 6, 4,-12,-16,-12,-12,-10, -5, 4,-11, 3,-13; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: M= -6, -8,-14, -9, -5, -5,-13, -5, -5, -2, -3, -1, -6,-13, -5, 0, -6, -4, -2,-14, -2, -5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='V'; M= -5,-13,-13,-14,-10, 3,-14, -9, 1, -7, 0, 1,-11,-16, -9, -4, -7, -3, 4,-11, 3,-11; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='R'; M= -7, -6,-15, -7, -4, -5,-15, -2, -6, -1, -5, -2, -5,-13, -4, 3, -6, -4, -4,-13, 0, -5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='K'; M= -5, 0,-17, 1, 4,-16, -9, -4,-17, 12,-15, -8, 1, -7, 4, 9, -1, -3,-12,-17, -8, 3; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='S'; M= 1, -2,-14, -3, -4,-12, -2, -9, -8, -6, -9, -6, -1, -8, -5, -7, 2, 0, -5,-18,-10, -5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: M= -3, -9,-14,-11, -6, -7,-11, -9, -1, -6, -2, 0, -7, -7, -4, -5, -4, -2, -1,-15, -6, -6; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='G'; M= -1, -5,-19, -4, -5,-17, 14,-10,-17, -9,-15,-10, -3, 2, -8,-10, -1, -8,-14,-16,-16, -7; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='A'; M= 3, -8,-12,-10, -4, -7,-11, -7, -5, -2, -2, -1, -7,-10, -3, -4, -4, -2, -3,-11, -4, -4; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='I'; M= -4,-16,-16,-16,-12, -1,-15,-13, 4,-11, 1, 0,-14,-10,-11,-11,-10, -5, 4, 3, -1,-11; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='S'; M= 0, 3,-14, 3, 4,-13, -4, -3,-14, 0,-14, -9, 5, -8, 1, -1, 6, 1,-11,-19,-10, 2; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='D'; M= -6, 13,-15, 17, 9,-19, -8, 1,-18, 1,-15,-12, 7, -5, 3, -2, 0, -4,-15,-21,-11, 6; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='I'; M= -3,-14,-14,-15,-10, 2,-17,-11, 7,-11, 7, 3,-13,-13,-11,-10, -9, -4, 7,-12, 0,-11; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='N'; M= -2, -2,-13, -6, -3, 0,-10, -5, -7, -4, -7, -6, 1,-12, -5, -5, -2, -3, -7,-11, 0, -4; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -7, 1,-17, 2, 4, -8,-12, -4,-10, -2, -5, -6, -1, -9, -1, -2, -4, -3,-10,-16, -6, 1; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -5, 0,-16, 1, 4,-11,-11, -4,-12, 2, -9, -7, -1, -7, 0, 2, -3, -5,-10,-15, -6, 2; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='L'; M= -4, -8,-14, -9, -4, -3,-14, -6, -1, -6, 1, -1, -7,-12, -5, -4, -5, -3, -1,-13, -2, -5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: M= -3, -4,-16, -5, -2,-10,-11, -7, -7, -1, -3, -3, -4, -9, -2, 0, -4, -3, -6,-16, -7, -3; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: M= -1, -4,-11, -5, -4,-10, -9, -8, -8, -6, -5, -4, -3,-12, -3, -5, -2, -3, -6,-17, -8, -4; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -3, -1,-18, 0, 4,-14,-10, -3,-13, 0,-12, -8, 0, -3, 1, 0, 1, -2,-11,-18, -8, 1; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -5, 3,-20, 3, 6,-17,-10, -1,-17, 2,-15,-10, 3, -3, 3, 0, 0, -4,-16,-21,-10, 4; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='L'; M= -7,-15,-18,-17,-12, 3,-20,-12, 6,-14, 7, 5,-13,-13,-11,-12,-10, -3, 4,-14, 0,-12; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='E'; M= -6, 2,-23, 4, 7,-22,-13, -4,-20, 5,-18,-12, 2, -8, 4, 4, 0, -3,-16,-26,-13, 5; D=0; /I: I=0; DM=-2; /M: SY='G'; M= 4, -5,-20, -6, -7,-20, 14,-12,-23,-11,-23,-15, 1,-12, -7,-12, 11, 0,-16,-25,-17, -8; /M: SY='H'; M= -7, 0,-23, -2, -1,-18, -8, 5,-22, -1,-19,-12, 4,-11, 0, 2, 1, -2,-18,-24, -7, -2; /M: SY='V'; M= -1,-18, -8,-24,-20, -3,-22,-19, 10,-18, 7, 6,-15,-23,-17,-17, -8, -1, 12,-25, -8,-19; /M: SY='A'; M= 6,-17,-19,-22,-19, -4, 4,-19, -7,-19, -5, -5,-13,-21,-19,-20, -5, -8, -2,-13, -9,-19; /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-34,-26, 13,-32,-23, 28,-27, 27, 19,-24,-25,-22,-22,-22, -8, 19,-17, 3,-25; /M: SY='G'; M= 17,-12,-19,-16,-16,-20, 27,-20,-21,-16,-17,-13, -7,-17,-16,-19, 3, -9,-11,-20,-21,-16; /M: SY='H'; M=-18, -1,-29, -2, -2,-15,-19, 83,-27,-10,-18, 0, 9,-20, 7, -2, -9,-18,-27,-27, 17, -1; /M: SY='T'; M= -2,-10,-14,-15,-12,-11,-20,-15, 0, -9, -5, -3, -6,-19,-10, -5, 2, 10, 7,-28,-11,-12; /M: SY='R'; M=-19,-10,-29,-10, -1,-19,-20, 0,-28, 28,-19, -9, 0,-20, 9, 66,-10,-10,-19,-20,-10, -1; /M: SY='W'; M= -8,-24,-27,-26,-18, 12,-23,-10, -1,-17, 9, 1,-22,-26,-14,-14,-20,-12, -7, 20, 19,-16; /M: SY='A'; M= 25, -6,-13,-11, -6,-20, -2,-14,-15, -9,-19,-14, -2, -6, -6,-14, 19, 7, -6,-28,-19, -6; /M: SY='T'; M= -2, -9,-15,-17,-14, -8,-23,-21, 5,-15, -3, -3, -5,-13,-12,-15, 9, 29, 7,-27, -8,-14; /M: SY='H'; M= -5, -6,-19,-11, -9,-13,-15, 3, -6,-10, -9, -2, 0,-17, -5, -8, -2, -2, -5,-27, -7, -8; /M: SY='G'; M= -4, 5,-26, 8, -8,-28, 33,-13,-34,-13,-26,-20, 5,-16,-12,-15, 4, -7,-24,-26,-23,-10; /I: I=-5; MD=-27; /M: M= -2, -9,-20, -9, -4,-12,-11,-13, -9, -8, -4, -5, -7, -6, -6, -7, -4, -4, -8,-23,-12, -6; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='P'; M= -1,-10,-17,-10, -6,-12,-10,-13, -4, -8, -8, -5, -9, 8, -8,-11, -2, -2, -2,-20,-12, -8; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='S'; M= 0, 3,-13, 1, -1,-17, -7, -8,-16, -6,-18,-13, 5,-12, -2, -7, 13, 10,-10,-26,-12, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='E'; M= -7, -6,-25, -5, 1,-14,-18,-10,-12, -5, -8, -7, -8,-11, -4, -4, -8, -8,-11,-13, -8, -2; /M: M= -2, -4,-20, -5, 0,-15,-11, -9,-14, -4,-13, -9, -3,-12, -4, -4, 0, -2,-10,-24,-10, -3; /M: SY='N'; M= -5, 16,-21, 6, -5,-20, 11, -3,-22, -7,-23,-16, 27,-19, -6, -6, 4, -5,-24,-30,-19, -5; /M: SY='A'; M= 13, -9, 8,-16,-12,-17,-13,-13,-13,-12,-13,-10, -7,-16,-11,-14, 3, 1, -5,-30,-16,-12; /M: SY='H'; M=-15, -1,-30, -1, 9,-29,-20, 52,-24, 0,-20, 0, 4,-15, 34, 4, -5,-15,-29,-25, 5, 19; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 89,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='F'; M=-16,-23,-22,-30,-22, 37,-27, 0, 4,-22, 10, 11,-16,-26,-22,-15,-18,-11, 1, -7, 18,-20; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='V'; M= -5,-14,-16,-17,-12, -1,-20,-10, 0,-10, -2, 0,-10,-19, -9, -6, -4, 0, 3,-19, -1,-11; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='S'; M= -4, -1,-19, -1, -5,-10,-10, -4,-13, -7,-12, -9, 0,-17, -6, -5, 2, -2, -8,-21, -5, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='E'; M= -6, 4,-21, 5, 7,-22, -1, -2,-24, -1,-19,-13, 3,-11, 2, -3, 0, -8,-20,-25,-14, 4; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -6, 3,-17, 3, -1,-16, -6, -4,-19, -3,-17,-12, 4,-13, -2, -1, 3, -1,-15,-25,-10, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='G'; M= -3, -2,-15, -2, -1,-13, 5, -7,-14, -2,-13, -8, 0, -6, -3, -3, -2, -6,-12,-11,-10, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='N'; M= -4, 1,-14, 1, 0,-11, -3, -1,-13, 1,-11, -7, 3, -8, 0, 3, -1, -3,-11,-12, -6, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='I'; M=-11,-25,-26,-28,-21, 6,-26,-17, 9,-17, 6, 4,-20,-25,-16,-12,-18,-10, 5, 8, 9,-20; /M: SY='A'; M= 9,-16,-11,-22,-17, -7,-16,-16, 2,-15, 0, 1,-14,-20,-14,-16, -2, 0, 7,-19, -7,-16; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-26, 17,-29,-23, 21,-26, 22, 13,-25,-27,-25,-21,-20, -8, 18,-14, 3,-25; /M: SY='V'; M= 10,-20, -9,-26,-21, -8,-18,-22, 11,-17, 3, 7,-19,-21,-17,-19, -4, 0, 19,-24,-12,-19; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='H'; M=-17, -8,-24, -9, -7, -2,-21, 61,-20,-13,-12, 0, 0,-22, -1, -6,-11,-16,-20,-19, 21, -7; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-29, 69,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-29,-20; /M: SY='E'; M= -9, 5,-26, 6, 19,-20,-18, -4,-13, -3,-13,-11, 4,-10, 5, -7, -1, -4,-15,-28,-13, 12; /M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-36,-27, 4,-36,-27, 39,-28, 26, 18,-22,-24,-21,-26,-21, -9, 26,-21, -1,-27; /M: SY='Y'; M= -8, -4,-23, -5, -3, -3,-14, -2,-11, -6,-12, -9, -2,-17, -6, -8, -2, -1,-10,-12, 11, -6; /M: SY='N'; M= -7, 26,-20, 13, -1,-21, 1, 2,-22, -2,-27,-18, 38,-17, -2, -3, 9, 2,-25,-35,-18, -1; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='Y'; M=-10,-18,-21,-22,-18, 24,-23, 3, -1,-16, 2, 0,-15,-24,-16,-14,-14, -8, -4, 5, 31,-18; D=-5; /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='E'; M= -5, 0,-24, 1, 5,-20,-14, -6,-16, 4,-13, -8, -1, -9, 3, 3, -3, -6,-14,-23,-12, 3; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='E'; M= -3, 1,-24, 4, 15,-23,-11, -6,-20, 2,-16,-12, -1, -4, 6, -2, 1, -4,-18,-26,-15, 10; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='L'; M= -9,-22,-21,-26,-19, 4,-27,-17, 20,-24, 28, 14,-18,-25,-17,-18,-21, -8, 11,-20, -2,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='R'; M=-14, -7,-28, -7, 0,-19,-20, -5,-22, 23,-18, -8, -2,-17, 5, 38, -9, -9,-14,-20, -8, 0; /M: SY='E'; M= -5, 5,-24, 5, 10,-22,-14, -3,-23, 8,-19,-13, 5,-11, 4, 8, 0, -4,-18,-26,-13, 6; /I: I=-2; MD=-12; /M: SY='E'; M= -9, -1,-26, 2, 13,-15,-17, -2,-20, 5,-15,-10, -3,-11, 5, 5, -5, -9,-19,-15, -5, 9; D=-2; /I: I=-2; MD=-12; /M: SY='L'; M= -7,-25,-18,-27,-19, 9,-26,-16, 16,-24, 35, 17,-25,-26,-17,-17,-23, -9, 9,-16, 2,-18; D=-2; /I: I=-2; MD=-12; /M: SY='E'; M= -4, -5,-21, -3, 9,-15,-15, -8,-10, 0, -6, -5, -6, -9, 2, -1, -4, -4, -9,-21,-11, 5; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='E'; M= 1, 1,-18, 1, 6,-18, -7, -6,-16, 0,-14,-10, 1, -9, 2, -2, 3, -2,-12,-22,-12, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='R'; M= -6, -5,-19, -5, -1,-12,-13, -6,-13, 0, -8, -6, -5,-14, -2, 2, -7, -8,-10,-17, -6, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='G'; M= -4, -7,-25, -8,-11,-14, 23,-10,-24,-10,-18,-12, -2,-16,-11, -8, -3,-12,-19,-15,-10,-12; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='Y'; M= -6,-12,-19,-14,-10, -3,-17, 5, -6,-10, -5, -2, -8,-17, -7, -8, -7, -6, -5,-14, 8,-10; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: M= -8, -6,-23, -7, -3,-13,-17, -2, -9, -3,-11, -5, -4,-13, 0, -1, -4, -4, -8,-19, -4, -3; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='F'; M=-13,-23,-20,-28,-20, 29,-26,-19, 2,-20, 5, 0,-17,-18,-24,-14,-15, -7, 1, -8, 8,-21; /M: SY='R'; M= -6, -4,-23, -5, 2,-18,-15, -4,-15, 3,-13, -7, -2,-15, 4, 5, -2, -3,-12,-23, -9, 2; /M: SY='S'; M= 2, -4,-18, -7, -9,-18, 14,-13,-22,-13,-21,-14, 2,-14,-10,-13, 15, 9,-13,-28,-17,-10; /M: SY='D'; M= -7, 11,-22, 13, 10,-24, -9, -1,-24, -1,-21,-15, 8,-11, 4, -3, 6, 1,-20,-31,-14, 6; /M: SY='T'; M= 2, -1, -9, -7, -8,-14,-11,-16,-12,-11,-16,-12, 3,-13, -8,-11, 21, 28, -3,-33,-15, -8; /M: SY='D'; M=-20, 47,-30, 66, 19,-38,-11, 0,-39, 0,-29,-29, 19,-10, 0,-10, 0,-10,-29,-39,-19, 9; /M: SY='T'; M= 5, -2, -6, -6, -6,-16, -7,-16,-16,-11,-20,-15, 3,-12, -7,-11, 26, 27, -6,-35,-16, -7; /M: SY='E'; M= -8, 8,-28, 16, 50,-28,-19, 0,-28, 8,-19,-18, -1, -3, 17, -1, -1,-10,-27,-27,-17, 33; /M: SY='V'; M= -3,-22,-13,-24,-21, -4,-26,-17, 13,-16, 4, 5,-20,-24,-19,-14,-10, -3, 22,-22, -6,-21; /M: SY='I'; M= -3,-27,-20,-32,-24, 4,-29,-24, 26,-25, 20, 14,-22,-23,-20,-23,-17, -8, 19,-20, -2,-24; /M: SY='F'; M= 0,-20,-19,-24,-17, 12,-20,-19, 3,-20, 11, 2,-18,-17,-20,-18,-12, -6, 3,-15, -1,-18; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='H'; M= -3, -6,-17, -9, -3,-15,-15, 18,-15, -5,-11, -3, -2,-15, 2, -2, -6, -9,-14,-22, 0, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='L'; M= -4,-22,-19,-24,-16, 4,-22,-16, 10,-21, 25, 11,-21,-23,-14,-16,-18, -6, 5,-13, 2,-15; D=-1; /I: I=-1; MD=-7; /M: SY='I'; M= -9,-24,-21,-28,-21, 15,-27,-14, 18,-21, 18, 12,-20,-22,-18,-18,-18, -8, 11, -7, 13,-21; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: M= -3, -3,-12, -3, -1, -7, -7, -5, -7, -4, -5, -4, -3, -7, -3, -4, -3, -3, -6,-11, -5, -2; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= -2, -1,-14, -1, 1,-10, -7, -3,-10, 0, -9, -6, -1, -4, -1, -2, -1, -2, -9,-12, -6, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: M= -4, -5,-15, -5, 0, -7,-11, -2, -7, -2, -4, -1, -5,-10, 0, -2, -4, -4, -6,-12, -2, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= -6, -4,-17, -3, 1, -9,-12, -3, -7, -2, -5, -4, -3, -7, -1, -1, -4, -4, -7,-16, -5, -1; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= -2, 0,-16, 0, 4,-14, -8, -2,-13, -1,-11, -7, -1, -5, 1, -2, 0, -3,-11,-18, -9, 2; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= -5, 1,-17, 2, 4,-13,-10, -3,-12, -1,-10, -7, 0, -7, 2, -2, -1, -3,-11,-17, -7, 3; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: M= -3, -2,-17, -2, -2,-14, -1, -5,-13, -3,-11, -6, -1, -8, -3, -4, -1, -4,-10,-17,-10, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: M= -3, -7,-18, -7, -3,-12, -6, -7,-11, -3, -7, -5, -6, -7, -4, -1, -5, -6, -9,-17, -8, -4; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='D'; M= -1, 9,-16, 11, 4,-20, -4, -6,-18, -3,-16,-13, 5, -7, -2, -7, 5, 0,-13,-24,-13, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='L'; M= -7,-16,-20,-17,-11, 4,-19,-12, 2,-15, 7, 2,-14,-14,-12,-13,-13, -6, -1, -7, 1,-12; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: M= -6,-11,-22,-12, -3, -7,-19, -8, -4, -7, 0, -1,-10,-15, -5, -5, -9, -7, -5,-20, -4, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='E'; M= -6, 3,-25, 5, 14,-21,-14, -1,-21, 3,-16,-12, 1,-10, 7, 2, -2, -7,-19,-22,-11, 10; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='A'; M= 5,-11,-24,-13,-10,-11, -4,-12,-14, -8,-12,-10,-10,-17, -8, -9, -4, -7,-11, -1, -4,-10; D=-1; /I: I=-1; DM=-7; /M: SY='I'; M= -6,-21,-21,-24,-20, -2,-13,-19, 7,-20, 7, 5,-17,-21,-17,-18,-13, -8, 7,-19, -5,-20; /M: SY='E'; M= -3, -8,-23, -9, 2,-15,-18, -9,-10, 0, -8, -4, -6,-12, 0, 1, -4, -4, -8,-24,-10, 0; /M: SY='E'; M= -5, 2,-22, 2, 5,-21,-10, -5,-20, 2,-16,-10, 1,-14, 2, 2, -1, -5,-16,-24,-11, 3; /M: SY='A'; M= 7,-17, -6,-23,-17, -3,-18,-20, 2,-17, 3, 1,-15,-21,-16,-16, -5, 1, 6,-21, -8,-17; /M: SY='L'; M= -6,-22,-14,-26,-19, 2,-25,-16, 12,-20, 16, 11,-19,-24,-16,-17,-15, -5, 10,-20, -3,-18; /M: SY='E'; M= -5, 3,-24, 4, 11,-24,-12, -5,-23, 6,-20,-14, 4, -8, 6, 5, 3, -2,-19,-27,-16, 8; /M: SY='R'; M= -9, -4,-26, -3, 6,-20,-18, -2,-19, 8,-15, -7, -4,-10, 6, 11, -5, -6,-16,-21,-10, 5; /M: SY='L'; M= -7,-26,-18,-30,-22, 8,-27,-22, 15,-25, 22, 10,-24,-24,-21,-21,-20, -7, 10,-11, 0,-22; /M: SY='D'; M=-10, 10,-25, 11, 9,-22,-15, -3,-21, 6,-19,-13, 7,-12, 3, 6, -2, -5,-18,-27,-13, 5; /M: SY='G'; M= 0, -8,-28, -9,-14,-28, 50,-16,-35,-15,-27,-17, 0,-17,-14,-15, 1,-15,-26,-21,-26,-14; /M: SY='A'; M= 2, -9,-21,-11, -5,-16,-11,-10, -9, -8,-10, 0, -7, -2, -4,-10, 0, -3, -8,-25,-13, -5; /M: SY='F'; M=-11,-21,-24,-26,-21, 32,-23, -5, -3,-17, 0, -2,-16,-26,-20,-14,-15, -8, -5, 12, 31,-21; /M: SY='A'; M= 24, -8,-14,-13, -8,-18, -3,-17,-11,-10,-12,-10, -6,-10, -8,-15, 10, 3, -4,-25,-18, -8; /M: SY='F'; M=-10,-25,-19,-30,-21, 21,-27,-18, 12,-23, 16, 9,-20,-24,-22,-17,-17, -7, 9,-14, 6,-21; /M: SY='A'; M= 12,-13,-11,-19,-16,-10,-12,-18, 2,-16, -2, -2,-10,-19,-15,-18, -1, -1, 8,-25,-13,-16; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='V'; M= 0,-11,-11,-15,-12, -2,-12,-12, 6,-12, 3, 3, -8,-14,-11,-12, -4, -1, 7,-16, -5,-12; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='L'; M= -6,-22,-20,-26,-20, 4,-24,-18, 19,-20, 20, 15,-20,-22,-16,-18,-17, -7, 13,-17, 0,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='Y'; M= -7,-12,-19,-15,-13, 2,-18, -9, -6,-13, -5, -5,-11,-19,-12,-12, -7, -3, -6, 1, 7,-13; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='D'; M= -7, 9,-22, 11, 2,-17,-12, -6,-19, -4,-16,-13, 3,-14, -3, -6, -2, -6,-14,-26,-11, -1; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='S'; M= -1, -1,-16, -1, 0,-17, -5, -6,-18, -2,-16,-11, 0, -9, -2, -3, 3, 0,-13,-23,-12, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='D'; M= -7, 8,-20, 10, 5,-15,-10, 0,-17, -1,-15,-11, 6,-10, 0, -1, -1, -5,-15,-22, -8, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='P'; M= -3, -5,-21, -4, -2,-18, 1,-10,-18, -3,-17,-12, -3, 6, -4, -4, 0, -3,-15,-18,-15, -4; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='D'; M=-10, 11,-26, 12, 7,-25, -3, 0,-27, 3,-21,-15, 10,-13, 3, 3, 0, -6,-23,-28,-15, 4; /M: SY='R'; M= -6, -5,-22, -6, 2,-17,-15, -8,-16, 5,-13, -8, -3,-15, 1, 6, -1, 0,-12,-21, -8, 0; /M: SY='L'; M= -6,-27,-19,-31,-22, 7,-29,-21, 22,-25, 27, 16,-24,-26,-20,-21,-19, -6, 18,-20, 0,-22; /M: SY='F'; M= -8,-23,-21,-27,-22, 16,-23,-14, 9,-21, 7, 4,-19,-25,-21,-18,-15, -7, 8, -4, 14,-22; /M: SY='A'; M= 11,-18,-10,-24,-18, -5, -9,-20, -1,-19, 4, -1,-16,-22,-18,-19, -7, -6, 4,-19,-10,-18; /M: SY='A'; M= 12,-16,-10,-22,-17, -4,-11,-18, -1,-17, -3, -2,-13,-19,-16,-18, -1, -1, 5,-21, -9,-17; /M: SY='R'; M=-12,-10,-24,-11, -2,-18,-19, -5,-23, 18,-15, -8, -3,-18, 5, 43, -6, -5,-14,-22,-11, -2; /M: SY='D'; M=-18, 33,-27, 43, 11,-29,-11, 4,-32, 1,-26,-22, 17,-14, 0, -3, -2, -9,-26,-32,-11, 5; /M: SY='P'; M= -6, -8,-26, -7, -3,-20, -9, -7,-22, 0,-20,-12, -4, 7, -3, 7, -2, -5,-19,-24,-16, -5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='F'; M= -6, -8,-18,-11, -9, 3,-15, -3, -2,-10, -1, 0, -4,-16, -8, -7, -6, -5, -4,-11, 3, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='G'; M= 1, -6,-22, -7,-11,-22, 36,-13,-26,-10,-21,-13, 0,-11,-10,-10, 1,-11,-20,-17,-20,-11; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='I'; M= -7,-15,-17,-19,-12, 2,-21,-14, 10,-12, 6, 5,-12,-17,-12, -9,-11, -5, 8,-16, -2,-13; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M= -8, -5,-23, -6, 2,-22,-15, -5,-24, 21,-22,-11, 1,-14, 6, 29, -1, -4,-16,-24,-12, 2; /M: SY='P'; M= -8,-17,-36,-10, 0,-27,-19,-17,-18, -9,-26,-18,-17, 69, -8,-17, -6, -6,-25,-29,-26, -8; /M: SY='L'; M= -5,-25,-18,-27,-18, 5,-23,-19, 12,-24, 30, 13,-24,-23,-18,-18,-20, -7, 7,-21, -4,-18; /M: SY='Y'; M=-10,-20,-14,-23,-19, 9,-26, -7, 2,-15, 3, 1,-16,-25,-16,-10,-12, -4, 4,-10, 15,-19; /M: SY='Y'; M=-11,-24,-23,-26,-21, 14,-28, -8, 11,-18, 11, 7,-22,-26,-17,-15,-18, -9, 7, 2, 24,-21; /M: SY='G'; M= 2,-10,-19,-12,-14,-17, 17,-12,-21,-14,-17,-12, -4,-18,-12,-14, 1, -7,-15,-19,-12,-13; /M: M= -9,-11,-23,-12, -4, -8,-22, -9, -6, -3, -5, -3,-10,-18, -5, -1, -9, -6, -4,-15, -2, -6; /M: SY='N'; M= -4, -1,-21, -2, -5,-17, -6, -8,-15, -5,-12, -9, 1,-16, -4, -4, 0, 0,-11,-25,-11, -5; /M: SY='D'; M= -7, 10,-25, 14, 9,-27, -5, -5,-25, 1,-23,-17, 6, -6, 1, -4, 1, -6,-21,-29,-17, 5; /M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 16, 6,-26, 4, -3,-28, -4,-23,-18, 9,-13, -3, -6, 2, -7,-22,-30,-18, 1; /I: I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='S'; M= -1, -5,-20, -6, -1,-14, -3, -8,-16, -6,-13,-10, -2,-14, -4, -6, 2, -2,-12,-21,-10, -3; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='F'; M=-10,-20,-21,-24,-19, 12,-25,-12, 8,-19, 10, 5,-17,-26,-17,-14,-15, -6, 6, -9, 12,-19; /M: SY='F'; M= -3,-21,-20,-26,-21, 10,-22,-16, 8,-18, 5, 4,-18,-22,-19,-17,-13, -7, 8, -8, 8,-20; /M: SY='F'; M=-10,-26,-19,-31,-24, 26,-28,-20, 14,-23, 12, 7,-21,-26,-25,-19,-16, -7, 14,-10, 8,-24; /M: SY='A'; M= 27, -9, -7,-15,-10,-20, 3,-18,-15,-12,-16,-13, -6,-12, -9,-18, 13, 3, -5,-27,-21,-10; /M: SY='S'; M= 9, 0,-11, -1, -1,-19, -2,-11,-18,-10,-27,-18, 8,-11, -1,-10, 34, 19, -9,-38,-19, -1; /M: SY='E'; M=-10, 14,-28, 23, 39,-30,-16, -2,-28, 5,-20,-19, 3, -5, 13, -3, 1, -8,-25,-31,-18, 26; /M: SY='T'; M= -1,-12,-21,-13, -9,-12,-19,-16, -1,-10, -5, -3,-11, -7,-10,-11, -2, 2, 2,-25,-10,-11; /M: SY='K'; M= -2, -8,-11,-10, -5,-19,-12,-12,-16, 1,-15, -8, -5,-12, -4, -2, -3, -5,-10,-26,-14, -5; /M: SY='A'; M= 20,-11,-12,-15,-10,-17, -4,-18,-10,-11,-12, -9,-10, -9,-11,-16, 5, -1, -2,-24,-18,-11; /M: SY='L'; M= -8,-26,-22,-29,-21, 11,-28,-20, 18,-24, 22, 11,-22,-25,-20,-20,-19, -8, 13,-16, 2,-21; /M: M= -8, -2,-24, 0, -4,-13,-17, -8, -9, -7, -4, -5, -5,-16, -6, -6, -7, -6, -7,-23, -7, -6; /I: I=-2; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9; /M: SY='T'; M= -4, -5,-19, -5, -1,-14,-15,-11, -8, -7, -8, -6, -5,-10, -6, -8, -1, 1, -6,-26,-11, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-9; /M: M= -5, -7,-24, -7, -5,-10, -9, -7,-12, -9,-10, -7, -5,-11, -8,-11, -4, -6,-10,-20, -5, -7; /M: SY='T'; M= -3, -5,-16, -8, -6, -9,-14,-13,-11,-10,-11, -9, -5,-10,-10,-12, -2, 1, -8,-22, -9, -9; /M: SY='E'; M= -4, 0,-22, 1, 7,-22,-10, -9,-21, 3,-19,-13, 0, -8, 2, 1, 0, -4,-16,-24,-15, 4; /M: SY='D'; M=-10, 3,-26, 4, 4,-16, -9, -3,-22, 2,-17,-12, 3,-14, 1, 4, -3, -7,-18,-24, -9, 1; /M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-26,-20, 2,-25,-22, 9,-15, 0, 1,-20,-20,-18,-15,-15, -8, 8, 2, 2,-19; /M: SY='R'; M= -9,-11,-24,-13, -7,-10,-16, -9,-10, -1, -8, -4, -7,-17, -4, 6, -7, -5, -8,-16, -5, -6; /M: SY='E'; M= -8, -1,-24, 1, 7,-17,-18, -3,-18, 4,-15,-10, -3, -9, 3, 4, -4, -5,-15,-21, -6, 3; /M: SY='L'; M= -8,-25,-20,-27,-20, 7,-28,-20, 18,-23, 23, 13,-24,-22,-20,-19,-19, -7, 16,-20, -1,-21; /M: SY='E'; M= -6, 2,-27, 5, 13,-25,-13, -6,-22, 3,-20,-14, 0, 7, 5, -1, -2, -7,-22,-28,-18, 8; /M: SY='P'; M= -5, -2,-31, 4, 5,-27,-14,-12,-20, -6,-24,-18, -5, 35, -4,-13, -3, -7,-23,-31,-23, -2; /M: SY='G'; M= -1, -3,-27, -3,-11,-27, 42,-14,-33,-12,-27,-18, 4,-17,-12,-13, 1,-14,-26,-23,-24,-12; /M: SY='E'; M= -7, 7,-24, 11, 20,-25,-12, 5,-25, 1,-19,-14, 3,-10, 9, -2, 2, -5,-22,-29,-13, 14; /M: SY='I'; M= -5,-23,-20,-27,-20, 5,-26,-15, 14,-18, 13, 12,-20,-23,-16,-15,-16, -6, 11,-12, 5,-19; /M: SY='L'; M= -2,-21,-19,-24,-18, 0,-21,-18, 9,-17, 10, 7,-19,-21,-16,-15,-13, -6, 10,-18, -3,-18; /M: SY='V'; M= -3,-14,-20,-16,-11, -6,-20, -9, 1,-12, 0, 1,-12,-19,-10,-11, -6, -2, 4,-20, -2,-12; /M: SY='I'; M= -7,-24,-21,-29,-23, 9,-27,-20, 19,-22, 13, 9,-20,-24,-20,-20,-15, -7, 16,-13, 3,-22; /M: SY='D'; M= -7, 8,-22, 10, 4,-23, -8, -7,-23, 1,-21,-15, 6,-11, 0, 1, 5, 0,-17,-29,-15, 2; /M: M= -4, -4,-23, -4, -1,-14,-15, -9,-13, -3,-10, -8, -4,-10, -4, -3, -4, -5,-10,-22, -9, -3; /M: SY='N'; M= -6, 5,-24, 5, 3,-21, 1, -6,-23, -3,-21,-15, 7,-10, -2, -5, 1, -6,-20,-27,-16, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
UniProtKB/Swiss-Prot release number: 56.4, total number of sequence entries in that release: 400771. Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 268 hits in 268 different sequences Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 268 hits in 268 different sequences Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences Number of known missed hits: 1 Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0 Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 % Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 99.63 %
Comments
MATRIX_TYPE: protein_domain Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed Matrix author: PS_Langendijk_Genevaux Taxonomic range: Archaebacteria, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1 FT_KEY: DOMAIN FT_DESC: Glutamine amidotransferase type-2 VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot	True positive hits: ASNB_BACSU (P54420), ASNB_ECOLI (P22106), ASND1_BOVIN (Q0V8E4), ASND1_CHICK (Q5ZJN0), ASND1_DANRE (Q8JFW1), ASND1_HUMAN (Q9NWL6), ASND1_MACFA (Q4R5D4), ASND1_MOUSE (Q8BFS9), ASND1_SCHPO (O74397), ASND1_YEAST (Q04489), ASNH1_METJA (Q58516), ASNH2_METJA (Q58456), ASNH_BACSU (P42113), ASNH_MYCBO (P64248), ASNH_MYCTU (P64247), ASNO_BACSU (O05272), ASNS1_LOTJA (P49092), ASNS1_PEA (P19251), ASNS1_YEAST (P49089), ASNS2_LOTJA (P49093), ASNS2_PEA (P19252), ASNS2_YEAST (P49090), ASNS_ARATH (P49078), ASNS_ASPOF (P31752), ASNS_BOVIN (Q1LZA3), ASNS_BRAOL (P49091), ASNS_CHICK (Q5ZJU3), ASNS_CRIGR (P19891), ASNS_DICDI (Q54MB4), ASNS_HUMAN (P08243), ASNS_MAIZE (P49094), ASNS_MESAU (P17714), ASNS_MIMIV (Q5UQE1), ASNS_MOUSE (Q61024), ASNS_ORYSJ (Q43011), ASNS_PONAB (Q5R6W9), ASNS_RAT (P49088), ASNS_SANAU (O24338), ASNS_SCHPO (P78753), ASNS_TRIVS (O24661), GFA1_CANAL (P53704), GFA1_SCHPO (Q09740), GFA1_YEAST (P14742), GFAT_MIMIV (Q7T6X6), GFPT1_HUMAN (Q06210), GFPT1_MOUSE (P47856), GFPT1_RAT (P82808), GFPT2_BOVIN (Q08DQ2), GFPT2_HUMAN (O94808), GFPT2_MOUSE (Q9Z2Z9), GFPT2_RAT (Q4KMC4), GLMS_ACIAD (Q6F6U8), GLMS_AERPE (Q9YCQ6), GLMS_AGRT5 (Q8UEH1), GLMS_AQUAE (O66648), GLMS_BACAN (Q81VN5), GLMS_BACC1 (Q73F49), GLMS_BACCR (Q81J01), GLMS_BACHD (Q9KG45), GLMS_BACHK (Q6HPL2), GLMS_BACLD (Q65P46), GLMS_BACSK (Q5WLG7), GLMS_BACSU (P39754), GLMS_BACTN (Q8AAB1), GLMS_BARHE (Q6G322), GLMS_BARQU (Q6FZH6), GLMS_BORBR (Q7WE36), GLMS_BORPA (Q7W334), GLMS_BORPE (Q7VRZ3), GLMS_BRAJA (P59362), GLMS_BRUAB (Q577Y1), GLMS_BRUME (Q8YC47), GLMS_BRUSU (Q8CY30), GLMS_BUCAI (P57138), GLMS_BUCAP (Q8KA75), GLMS_BUCBP (P59499), GLMS_CAMJE (Q9PMT4), GLMS_CAUCR (Q9ABV2), GLMS_CHLAB (Q5L589), GLMS_CHLCV (Q821Z7), GLMS_CHLMU (Q9PLA4), GLMS_CHLPN (Q9Z6U0), GLMS_CHLTE (Q8KG38), GLMS_CHLTR (O84823), GLMS_CLOAB (Q97MN6), GLMS_CLOPE (Q8XHZ7), GLMS_CLOTE (Q890U2), GLMS_CORDI (Q6NG33), GLMS_COREF (Q8FNH2), GLMS_CORGL (Q8NND3), GLMS_CYACA (O19908), GLMS_ECO57 (Q8XEG2), GLMS_ECOL6 (Q8FBT4), GLMS_ECOLI (P17169), GLMS_ERWCT (Q6CYJ9), GLMS_FRATT (Q5NHQ9), GLMS_FUSNN (Q8RG65), GLMS_GEOKA (Q5L3P0), GLMS_GEOSL (Q74GH6), GLMS_GLOVI (Q7NIG8), GLMS_GLUOX (Q5FUY5), GLMS_HAEDU (Q7VKK4), GLMS_HAEIN (P44708), GLMS_HALSA (Q9HT00), GLMS_HELPJ (Q9ZJ94), GLMS_HELPY (O26060), GLMS_IDILO (Q5QZH5), GLMS_LACLA (Q9CGT6), GLMS_LACPL (Q88YE7), GLMS_LEGPA (Q5X153), GLMS_LEGPH (Q5ZRP4), GLMS_LEGPL (Q5WSX8), GLMS_LEIXX (Q6AD32), GLMS_LEPIC (Q72V57), GLMS_LEPIN (Q8EZQ1), GLMS_LISIN (Q92DS8), GLMS_LISMF (Q722H1), GLMS_LISMO (Q8Y915), GLMS_METAC (Q8TLL3), GLMS_METJA (Q58815), GLMS_METKA (Q8TZ14), GLMS_METMA (Q8Q038), GLMS_METMP (Q6LWM9), GLMS_METTH (O26273), GLMS_MYCBO (P0A589), GLMS_MYCLE (P40831), GLMS_MYCPA (Q73S23), GLMS_MYCS2 (O68956), GLMS_MYCTU (P0A588), GLMS_NEIG1 (Q5F584), GLMS_NEIMA (Q9JWN9), GLMS_NEIMB (Q9K1P9), GLMS_NOSS9 (O68280), GLMS_OCEIH (Q8ETM5), GLMS_PASMU (P57963), GLMS_PHOLL (Q7NA97), GLMS_PHOPR (Q6LLH3), GLMS_PSEAE (Q9HT25), GLMS_PSEPK (Q88BX8), GLMS_PSESM (Q87TT8), GLMS_PYRAB (Q9V249), GLMS_PYRAE (Q8ZTZ0), GLMS_PYRFU (Q8U4D1), GLMS_PYRHO (O57981), GLMS_PYRKO (Q5JH71), GLMS_RALSO (Q8Y303), GLMS_RHILO (Q98LX5), GLMS_RHIME (Q92PS4), GLMS_SALPA (Q5PKV9), GLMS_SALTI (Q8Z2Q2), GLMS_SALTY (Q8ZKX1), GLMS_SHEON (Q8CX33), GLMS_SHIFL (Q83IY4), GLMS_STAAC (Q5HE49), GLMS_STAAM (P64227), GLMS_STAAN (P64228), GLMS_STAAR (Q6GES3), GLMS_STAAS (Q6G7F8), GLMS_STAAW (Q8NVE6), GLMS_STAEQ (Q5HM69), GLMS_STAES (Q8CRL1), GLMS_STRA3 (Q8E5P8), GLMS_STRA5 (Q8DZZ7), GLMS_STRCO (O86781), GLMS_STRMU (Q8DTY0), GLMS_STRP1 (Q99ZD3), GLMS_STRP3 (Q878N9), GLMS_STRP6 (Q5XBV6), GLMS_STRP8 (Q8P0S7), GLMS_STRPN (Q97SQ9), GLMS_STRR6 (Q8DRA8), GLMS_SULAC (Q4J6D9), GLMS_SYMTH (Q67T12), GLMS_SYNEL (Q8DJI6), GLMS_SYNY3 (P72720), GLMS_THEMA (Q9WXZ5), GLMS_THET2 (Q72HF4), GLMS_THET8 (Q56213), GLMS_THETN (Q8R841), GLMS_THIFE (Q56275), GLMS_TREPA (O83833), GLMS_TROW8 (Q83IA1), GLMS_TROWT (Q83FU2), GLMS_VIBCH (Q9KUM8), GLMS_VIBF1 (Q5E279), GLMS_VIBPA (Q87SR3), GLMS_VIBVU (Q8DEF3), GLMS_VIBVY (Q7MP62), GLMS_WIGBR (Q8D3J0), GLMS_XANAC (Q8PGH9), GLMS_XANCP (Q8PCY1), GLMS_XYLFA (Q9PH05), GLMS_XYLFT (Q87F28), GLMS_YERPE (Q8Z9S8), GLMS_YERPS (Q663R1), GLMS_ZYMMO (Q5NRH4), GLSN_MEDSA (Q03460), GLT1_SCHPO (Q9C102), GLT1_YEAST (Q12680), GLTA_BACSU (P39812), GLTB1_ARATH (Q9ZNZ7), GLTB2_ARATH (Q9T0P4), GLTB_ANTSP (Q06434), GLTB_AZOBR (Q05755), GLTB_CYACA (O19906), GLTB_ECOLI (P09831), GLTB_HORVU (Q08258), GLTB_MAIZE (P23225), GLTB_PORPU (P51375), GLTB_PORYE (Q1XDB2), GLTB_SPIOL (Q43155), GLTB_SYNY3 (P55037), GLTS_SYNY3 (P55038), GLXB_RHIME (O87390), NODM1_RHIME (Q92ZK3), NODM2_RHIME (P25195), NODM_BRAJA (P94323), NODM_RHILT (Q52846), NODM_RHILV (P08633), PUR1_ARCFU (O29388), PUR1_BACSU (P00497), PUR1_CHICK (P28173), PUR1_DICDI (Q86A85), PUR1_DROME (Q27601), PUR1_ECOLI (P0AG16), PUR1_HAEIN (P43854), PUR1_HUMAN (Q06203), PUR1_LACCA (P35853), PUR1_METJA (Q57657), PUR1_METTH (O26742), PUR1_MYCBO (P65830), PUR1_MYCLE (Q50028), PUR1_MYCTU (P65829), PUR1_PASMU (Q9L6B8), PUR1_PSEAE (Q51342), PUR1_PYRAB (Q9V253), PUR1_PYRHO (O57979), PUR1_RAT (P35433), PUR1_RHIET (P77935), PUR1_SACKL (Q12698), PUR1_SCHPO (P41390), PUR1_SHIFL (P0AG17), PUR1_SOYBN (P52418), PUR1_STAAC (Q5HH14), PUR1_STAAM (P65831), PUR1_STAAN (P99164), PUR1_STAAR (Q6GI14), PUR1_STAAS (Q6GAE3), PUR1_STAAW (Q8NX91), PUR1_STAEQ (Q5HQA0), PUR1_STAES (Q8CT30), PUR1_SYNE7 (Q55038), PUR1_SYNY3 (Q55621), PUR1_VIGAC (P52419), PUR1_YEAST (P04046), QUEC2_SULTO (Q96Y49), QUEC_SULAC (Q4JBY3), QUEC_SULSO (Q981C9), Y1037_HAEIN (P44098), Y1515_METJA (Q58910), Y191_METTH (O26293), Y199_SYNY3 (P54004), Y398_THEMA (Q9WYM9), Y952_ARCFU (O29310), YAFJ_ECOLI (Q47147), YD5A_METJA (P58018), YM084_YEAST (Q6B308), YNT1_YEAST (P53871) False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile): ASND1_DROME (Q5LJP9) Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format] Retrieve the sequence logo from the alignment
PDB [Detailed view]	1AO0; 1CT9; 1EA0; 1ECB; 1ECC; 1ECF; 1ECG; 1ECJ; 1GPH; 1JXA; 1LLW; 1LLZ; 1LM1; 1OFD; 1OFE; 1XFF; 1XFG; 2BPL; 2J6H; 2VDC;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)